本实用新型公开了一种二次供水自动控制系统。它包括蓄水箱、采样箱和主控箱，蓄水箱连接有进水管和出水管，出水管上设有出水电磁阀，其一侧连接有采样管，采样管上设有采样电磁阀，且其与所述采样箱连接，所述采样箱下侧设有排放管，且其上侧设有透气管，所述排放管上设有排放电磁阀，采样箱的内部设有液位开关和水质检测传感器，主控箱包括控制单元和与控制单元连接的水质检测仪，出水电磁阀、采样电磁阀、排放电磁阀和液位开关分别与控制单元连接，水质检测传感器与水质检测仪连接。本实用新型不会对蓄水箱增加污染和泄漏风险，检测精确度高，可实现定期循环检测，改造成本较低，且便于使用。