本实用新型公开了一种隔离门机构，具体涉及隔离设备技术领域，包括隔离门，所述隔离门一侧设置有丝杆模组，所述丝杆模组顶部和底部一侧分别设置有上光电开关和下光电开关，所述隔离门另一侧设置有高速静音导轨，所述高速静音导轨上配套设置有滑块。本实用新型通过设置有丝杆模组，打开电机，电机可以通过丝杆模组带动隔离门上升或下降，当连接基板被上光电开关识别到时，电机停止转动，这时隔离门打开；当药品输送过后，电机反向启动，隔离门向下移动，当连接基板被下光电开关识别到时，电机停止转动，这时隔离门关闭，可以防止恒温恒湿的药品储存箱体中的低温气体不泄露和外部常温气体的流入，从而保证药品储存的温度和湿度。