本实用新型公开了一种FFPE样本预处理装置，涉及FFPE样本脱蜡的技术领域，包括相互连通的预处理腔室、存储腔室、分隔腔室，还包括：凸块，固定设置在分隔机两端部；卡槽，开设在预处理机构靠近分隔机构的一侧，开设在储存机构靠近分隔机构的一侧；固定槽，固定槽与卡槽相互连通设置；伸缩分隔板，设置在分隔机构沿高度方向的两端侧。将水相层和油相层之间的分离层面设置在分隔腔室内，再通过设置伸缩分隔板，将分隔腔室与预处理腔室、分隔腔室与存储腔室完全隔开，使水相层和油相层完全分隔，待试验人员收到装置时，直接利用移液管吸取存储腔室中的溶液便可进行试验，方便快键，且避免了油相层的干扰，有效提高试验结果可信度。