本实用新型公开了一种黑臭水体污染治理微生物反应器，包括一个呈下端开口设置的处理桶，所述处理桶靠近下端开口处的内桶壁上设置有螺纹，所述处理桶的下端开口处螺纹连接有一个出水机构，所述处理桶的上表面固定连接有一个支撑机构，所述处理桶的内部设置有一个搅拌机构，与现有技术相比，本实用新型的有益效果是：在使用时，将本装置放置于水中，漂浮板带动处理桶漂浮在水中，同时并启动驱动电机与加热板，加热板使得滤块板快速繁衍出菌群对水进行反应，同时驱动电机通过转动杆带动转动叶片进行转动，对水与进行菌群进行混合搅拌，同时将水向下方的过滤网板上输送，并在通过过滤网板的过滤后由出水管中排出，提高了装置的净化效率与范围。