本实用新型涉及生物发酵装置技术领域，具体地说，涉及一种内置搅拌结构的培养箱，包括培养箱主体，培养箱主体内设置有若干搅拌装置，搅拌装置包括铰板、搅拌轴以及转动马达，铰板的首端设置有第一磁铁，搅拌轴通过顶块吸附在第一磁铁上，搅拌轴的底端与转动马达的输出轴末端均紧密焊接有横置棒，横置棒的首末两端均设置有第二磁铁。该内置搅拌结构的培养箱，通过设置在培养箱主体内的搅拌装置，使得培养杯被放置在凹槽内并将转动马达与外界电源相接通后，转动马达带动横置棒转动，在磁力的作用下带动搅拌轴上的横置棒转动，从而达到搅拌效果，通过磁力将搅拌轴吸附在铰板上，使得铰板与搅拌轴能够在拨动下直接分离，以便对搅拌轴进行清洗。