本实用新型属于样本保存设备技术领域，尤其一种微生物样本保存装置，包括保存箱和设在保存箱侧壁上的多组通风孔，保存箱的顶部一侧铰接有盖板，盖板的两侧均设有凹槽，凹槽的内部设置有压紧机构，压紧机构的底部连接有抵压板，抵压板的中间位置配合安装有温度传感器，保存箱的内底壁两侧均焊接有弹簧柱，两个弹簧柱的顶部固定连接有支撑板，支撑板的顶部活动设置有放置板，放置板的顶部设有多个放置槽，多个放置槽的内部活动插设有样本试管，保存箱的内底壁中间位置通过锁紧螺栓安装有吸风机；本实用新型提高了微生物的保存效果，进一步避免样本被破坏，取出方便，保存效果好，方便使用，适合推广。