本实用新型公开了一种树根灌药用的辅助系统，涉及树根灌溉领域，针对无法保证药物投放的均匀，容易出现局部药物量过多，不但防治效果差，甚至对根部产生不良影响，药液被土壤过早吸收，无法到达树根位置，土壤太湿，药液不容易渗入土壤，也无法到树根位置等问题，现提出如下方案，包括箱体，所述箱体顶部两侧焊接有侧板，所述箱体的顶部焊接有固定罩，两个所述侧板的顶部焊接有与固定罩焊接的储药箱，所述储药箱的顶部活动套设有活塞，所述箱体的底部内壁固定连接有驱动电机。本实用新型结构简单，设计新颖，使用方便，能够将药剂运输到树木的底部，从而方便树根进行吸收，通过输液孔能够让树木缓慢吸收，防止药剂流入过多导致土壤污染。