本实用新型公开了一种水产加工污水处理系统，包括沉砂装置、去油、分离装置、蛋白质分离装置、水解装置、消毒装置、离心脱水装置和消泡装置，所述去油、分离装置和蛋白质分离装置包括底板，底板的顶部固定连接有过滤箱，过滤箱的内壁之间固定连接有外过滤筒，本实用新型涉及污水处理技术领域。该水产加工污水处理系统，通过转轴带动涡流转叶转动，然后启动第一水泵带动进水管进行抽水，并通过出水管将油污通入油污箱内进行收集，配合内过滤筒和滑套在外过滤筒的内表面上下滑动，可以有效的去除并收集水产加工污水中的油污，无需人工收集，工作效率高，并且污水进行固液分离时，内过滤筒上移清理，操作便捷，减轻了工人的劳动强度。