本实用新型公开了一种北虫草分段培养器，包括底托、上盖以及中间套，所述底托的上部开口，所述上盖的下部开口，所述中间套的上下两部均开口，所述中间套可拆卸的套设在底托上，所述上盖可拆卸的套设在中间套上且中间套的外壁与上盖内壁之间具有间隙，上盖和中间套上还分别开设有第一透气孔和第二透气孔，培养基装设在底托内，然后用户可以方便的根据需求组装中间套和上盖，接种之前灭菌时，只需将上盖和带有培养基的底托放入灭菌设备内即可，有效利用了灭菌设备的容积，提高了灭菌效率，大大的方便了工作人员的接种和培养基装卸工作，当北虫草向子实体阶段过渡时，将中间套装设在上盖和底托之间，给北虫草子实体的生长提供空间。