本实用新型提供了一种采光顶的排水结构，包括支座、采光顶玻璃板块副框，所述支座和副框均采用型材；所述支座的顶部的两侧分别设置安装部位而用于采光顶玻璃板块的安装，所述支座顶部的中部在两侧的安装部位之间设有排水槽的安装槽，所述安装槽的底部低于两侧的所述安装部位，安装槽的两侧槽壁则高于两侧的所述安装部位，所述排水槽设置在安装槽中，排水槽的槽壁高于安装槽的槽壁；所述排水槽正好处在相邻采光顶玻璃板块的接缝下方。本实用新型结构合理且能够适于二次导水系统的设置，增加导水排水能力。并且，本实用新型还适用于光伏玻璃采光顶，使接线盒能被隐蔽式安装，保证立面的完整性。