本实用新型公开了一种免疫荧光自动恒温机构，包括：恒温箱本体、温度控制模块、荧光检测模块，所述恒温箱本体包括基座、上壳，所述基座的顶部嵌入设有测试仓，所述基座的底部外侧嵌入设置有用于安装加热装置的腔体和引线槽，所述基座的前面设有第一插卡口，所述上壳活动设置在所述基座的上部，所述温度控制模块包括温度传感器、熔断器、电路板及设置在电路板上的管理电路，所述荧光检测模块设置在述恒温箱本体的内部。本实用新型使用加热膜恒温，形成37度的反应环境，促进待反应物更好发生反应，增加测试结果的灵敏度。使用温度调节算法以及防错设计，使系统更加稳健。通过铝板传递热量使升温更加平稳，空间热均衡性更好。