本实用新型公开了一种多通道小动物代谢监控系统，圆形活动笼顶部设置有动物气体换气装置和数据收集接头，数据收集接头与电脑相连，圆形活动笼一侧设置有光栅传感器、饮水控制装置、食物控制装置，圆形活动笼底部连接有尿液粪便分离漏斗，尿液粪便分离漏斗下方分别对应设置有玻璃粪便收集杯、玻璃尿液收集杯，玻璃粪便收集杯、玻璃尿液收集杯下方设置有电子冷却器。本实用新型结构设计合理，操作方便可靠，能够有效获得实验数据，测量准备有效，可以进行饮食量、饮水量、运动量的统计，同时可以进行尿粪分离收集，能够进行大量动物的同步实验，性价比高，实用性强。