本实用新型公开了一种具有清理结构的自动锁芯钻床，包括工作台，所述工作台顶部的中端固定连接有机架，所述机架左侧的底部开设有第一凹槽，所述机架的左侧且位于第一凹槽的上部开设有第二凹槽，所述第二凹槽的内腔通过轴承转动安装有螺纹杆，所述螺纹杆的外表面螺纹连接有螺纹套，所述螺纹套的左侧固定连接有安装座，所述安装座的左侧安装有第一电机，所述第一电机的输出轴安装有钻头。本实用新型通过挡板、钻头、第一电机、第二电机、导料板、进料口、夹板、滑槽、螺纹套、螺纹杆、滑块、第一电动伸缩杆、清洁刷和第二电动伸缩杆相互配合，解决了现在的锁芯钻床不具有清理结构，导致每次都需要手动清理，非常麻烦的问题。