本实用新型涉及发酵箱密封技术领域，更具体地说，它涉及一种安装于箱体内搅拌装置的密封结构，包括转动轴，所述转动轴的端部设有安装于箱体侧壁的固定座，所述固定座设有安装孔，所述安装孔的内壁安装有轴承，所述轴承的两侧分别安装有法兰盘，所述法兰盘和所述轴承之间设有密封圈，所述法兰盘和所述转动轴之间设有密封加工垫。通过设置密封圈，能够对轴承的孔隙进行密封，防止水从轴承的孔隙中流出，密封加工垫能够密封法兰盘和转动轴之间的缝隙，防止水浸出，这样设置的密封圈和密封加工垫达到多重密封防护，从而避免了箱体内气体和水分的泄露，提高了密封性和发酵效果。