本实用新型揭示了一种遥控器及保护系统，所述遥控器包括：按键模块和射频传输模块，射频传输模块包括：按键控制模块、编码控制模块、发射强度控制模块和逻辑控制模块，当按键控制模块未识别到有效按键信号时，发射强度控制模块输出第一发射强度，编码控制模块输出第一协议编码，当按键控制模块识别到有效按键信号时，发射强度控制模块输出第二发射强度，编码控制模块输出第二协议编码；逻辑控制模块用于控制射频信号输出。本实用新型中的遥控器及保护系统使用同一种频率、不同编码，且发射强度等关键参数可以软件升级，硬件方面不需要做任何改动。应用本实用新型，使得电动自行车的解锁密码保护性强，安全性好，并且使得操作水平更加智能化和人性化。