本实用新型公开了一种水稻选种高效杀菌装置，涉及水稻选种杀菌装置技术领域，具体为一种水稻选种高效杀菌装置，包括支撑架，所述支撑架顶部的右侧固定安装有清洗缸，且清洗缸的正面活动套接有转动轴，所述转动轴的外部固定套接有从动齿轮，且从动齿轮的外部活动套接有传动齿条，所述清洗缸右侧的下方活动安装有传送板，所述支撑架顶部的右侧固定安装有烘干缸。该水稻选种高效杀菌装置，通过转动轴对清洗缸内部的水稻进行搅拌，使精选后的水稻与杀菌药剂充分混合，提高了杀菌的效果，通过驱动电机带动驱动齿轮转动，进而带动烘干缸内部的搅拌杆转动，对进入烘干缸内部的水稻进一步筛选，进一步降低水稻中的杂质。