本实用新型公开了一种养殖用羊群消毒系统，包括底盘，所述底盘顶部外壁的两侧均通过螺栓固定有安装架，且两个安装架的顶部外壁均通过螺栓固定有储液桶，其中一个所述安装架的一侧外壁通过螺栓固定有齿轮箱，所述底盘底部外壁的两侧均通过轴承固定有滚轮，且两个滚轮之间连接有同一个安装轴，所述安装轴的外壁套接有蜗杆，所述底盘底部外壁通过轴承固定有蜗轮，所述蜗轮和蜗杆相互啮合，所述齿轮箱的一侧内壁通过轴承固定有第一锥齿轮。本实用新型通过在储液桶中设置搅拌杆，通过蜗杆、蜗轮和齿轮箱之间的配合，将滚轮转动的动能来驱动搅拌杆进行转动，进而帮助搅拌桶内的消毒液进行搅拌，解决了现有的消毒装置不能配置消毒液的问题。