本实用新型公开了一种生物分离提纯装置，包括装置主体，所述装置主体底部设有盒槽，所述盒槽内设有储存盒，装置主体顶部固定有电控箱，所述电控箱内设有分离电机和电子组件，且装置主体上设有电控器，所述电控箱上固定有防尘外罩体，所述防尘外罩体内固定设有分离旋转盘体，且防尘外罩体底部通过固定架安装有分离刮板。该生物分离提纯装置通过在防尘外罩体内设置分离刮板，来对分离提纯过程中的杂质进行阻隔，防止分离提纯过程中产生污染，并且在防尘外罩体正下方设置存放最终产物的储存盒来对最终产物进行完整的收集，通过固定架方便对分离刮板进行安装，并且通过电控器来控制整组装置，实现自动化操作。