本实用新型涉及病理组织处理设备领域，特别涉及一种自动包埋机的包埋盒数量检测机构，用于检测篮体内包埋盒的数量，检测机构包括：基座；承托座；驱动件；压杆，与基座沿竖向滑动连接，压杆的下端伸至基座的下侧，且基座向下移动时，压杆能够伸入容纳腔内并与包埋盒的顶部抵接；弹簧，连接基座和压杆；检测件，设置于压杆上侧的基座上，压杆上移时能够触发检测件；测距件，设置于包埋机内，适于检测基座竖向移动的距离；控制器，与驱动件、检测件、测距件相连，适于接收检测件的触发信号时控制测距件测距。本实用新型能够快速、自动的对篮体内的包埋盒计数，还可消除包埋盒之间间隙带来的影响，有效的解决了现有技术中存在的问题。