本实用新型提供了涉及水处理领域的一种电磁强氧化焦化废水深度处理系统，其中，包括过滤器、电磁氧化反应器、浓水箱及回水箱；过滤器的进水端与污水管道连通，过滤器的出水端与电磁氧化反应器的进水端连通，电磁氧化反应器的出水端连通有两个出水支管，一个出水支管与浓水箱连通，另一个出水支管与回水箱连通；本实用新型在氧化剂存在的条件下，在强电磁场中，使废水的有害物质发生强烈的、自身或被动的分子裂解、氧化分解反应，生成为无害气体或固体沉淀物从水体中分离出去，达到废水净化的效果，同时，在强电磁场的辐射作用下，使细菌、藻类等生物细胞被分解、破坏而杀死，达到杀菌、灭藻的目的。具有低能耗、高效率的优点。