本实用新型涉及戊糖萃取技术领域，且公开了一种全保护戊糖中单糖中间体的萃取装置，包括萃取层，所述萃取层的顶部固定安装有分离层，所述分离层的顶部固定安装有电机，所述电机的底部固定连接有转动轴，所述转动轴的外部固定连接有桨片。该全保护戊糖中单糖中间体的萃取装置，通过设置过滤网固定连接回收组件使得对桨片加工过程中没有均匀分解的原谅进行过滤回收，以便对后续尾料的一并收集处理，通过在分离层的底部设置消毒组件对分解后的原料进行消毒处理，同时配合分流管内部的筛网对原料进行两次筛选，成品将通过成品管流出而未成品将通过三通阀与储存箱中的尾料进行交汇一同从尾料管中流出，方便收集或者二次处理。