本实用新型公开了一种控藻浮游动物运输投放装置，具体涉及控藻浮游动物领域，包括箱体，所述箱体的一端固定安装有电池盒，且箱体的一端靠近电池盒上方位置处固定连接有把手，所述箱体的另一侧铰接有输料板，且箱体的另一侧靠近输料板上方位置处固定连接有排料管，所述输料板的前后两侧均通过销轴转动连接有活动杆，所述箱体的前表面安装有控制开关。本实用新型中驱动机构的设计，清洁刷的转动，既能够拨动堵塞在排料管端口的浮游动物，避免了在投放过程中造成堵塞的现象，并且还能对箱体的内壁进行扫刷清洁，提高了清洁效果，保证了良好的清洁效果，该装置移动方便，具有良好的缓冲效果，方便了使用者进行投放，便于推广。