本实用新型提供一种生物制药用玻璃仪器清洗装置，包括清洗箱，清洗箱底部设有支撑腿，清洗箱底部设有排水口，清洗箱内设有放置板，放置板上设有漏水孔，放置板上设有供空心轴穿过的通孔，空心轴下端转动安装在清洗箱内的缓存盒顶部并与缓存盒连通，空心轴设有喷水孔和刷毛，缓存盒通过进水管以及增压泵与水源连通，清洗箱底部设有驱动电机，驱动电机的输出端与驱动轴连接，驱动轴通过传动机构对空心轴进行驱动，放置板上方设有固定机构，所述固定机构包括设置在玻璃仪器两侧的夹持板，夹持板和清洗箱内壁之间设有弹簧。该装置不需要对玻璃仪器中添加或倒出清洗液，实现刷洗和冲洗同时进行，提高清洗效率。