本实用新型公开了一种水利工程全自动启闭机，包括地面，所述地面的顶部贯穿设置有闸门架，所述闸门架内壁的底部固定连接有密封座，所述密封座的顶部开设有密封槽，所述密封槽的内腔设置有闸门本体，所述闸门本体正表面和背表面的两侧均设置有防护挡板，所述防护挡板的一侧与闸门架固定连接。本实用新型解决了闸门开启的过程中，排水时，闸门底部的密封处容易出现较多淤泥，在闸门关闭时，会影响闸门与其连接处的密封，会出现漏水的情况的问题，该水利工程全自动启闭机，能够保证闸门开合和关闭的前提下，还能对闸门底部的淤泥进行处理，使得闸门关闭的密封性不会受到影响，提高了全自动启闭机的实用性。