本实用新型涉及一种智能无菌加湿系统，包括净水总成及电气总成，所述净水总成包括发生器，所述发生器顶部分别连接引风管及出风管，所述引风管中部设有引风机；所述发生器底部设有液位开关，一侧连接RO膜、活性炭过滤层及粗滤层，所述粗滤层、活性炭过滤层及RO膜从上至下依次连接，所述粗滤层远离活性炭过滤层的一端连接进水口；所述发生器与RO膜之间连接加压泵；所述电气总成包括控制器，所述控制器内设CPU、若干电源、若干继电器，所述控制器连接人机界面。所述加压泵与发生器及RO膜之间的连接管上设有放水阀、若干反冲阀及反冲放水阀，所述反冲放水阀及放水阀之间设有废水出口。本实用新型的优点是，高效节能、智能化程度高、不会造成热污染。