本实用新型涉及海上执法系统技术领域，具体涉及一种海上无人检验取样系统，旨在解决目前需要执法人员赴现场或者登船进行检查取样的问题，其技术要点在于包括若干待检验船只；检验取样子系统，用于对待检验船只进行沟通、检查及取样；通讯终端，与检验取样子系统连接，用于获取待检验船只的实时信息；其中，检验取样子系统包括无人船，与通讯终端通信连接，用于远程航行、样品存储运输及无人机的运输、能源供给；无人机，与通讯终端通信连接，用于在无人船达到指定区域后，起飞进行拍照、检验、与待检验船只沟通交互及登船取样。本实用新型减少了海关人员实地取样的时间开销，通过无人机及无人船判断船只是否符合通关要求，极大地增加通关效率。