本实用新型提供了复合废气处理装置，包括：生物处理装置，包括预处理单元及生物处理单元，预处理单元包括第一喷淋机构，以调节复合废气的酸碱性，生物处理单元包括填料层以及第二喷淋机构，填料层为附着有微生物菌种的填料；燃烧装置，具备一炉体，内设含金属催化剂的催化体，炉体进气口与生物处理装置中容器的出气口连接,本装置通过预处理单元喷淋处理废气，以将废气中对菌剂毒性较高的成分去除，进而通过接种有复合菌剂的填料层以生物降解废气，生物降解后的废气排入炉体催化燃烧，最后排放,将生物处理工序与燃烧处理工序联合，有效处理医药、化工行业产生的高浓度废气，废气处理效率高，同时大幅降低成本。