本实用新型公开了一种微生物菌类培养摇床，包括位于地面上的底座、两个固定板和摇床，所述摇床匹配设置在底座上，两个所述固定板设置在底座上侧壁两端，且两个固定板关于摇床位置对称，每个所述固定板靠近摇床的侧壁对称设置有第一转轴，所述摇床两端侧壁设置有第二转轴，每个所述第一转轴与对应的第二转轴之间通过对应的铰接杆铰动连接，所述地面上还设有驱动电机，所述驱动电机输出轴固定连接有圆盘，所述圆盘上侧壁设置有偏心轴，两个所述固定板靠近偏心轴的一端固定设置有横板。本实用新型确保摇床内微生物菌种受到均匀的振荡，从而提高微生物菌种的培养效率，确保微生物菌种的生长状况大致相同，降低了次品率。