本实用新型公开了一种多功能菌种接种装置，包括接种瓶；所述接种瓶包括宽口瓶身，瓶盖和接种管。所述宽口瓶身的瓶口为漏斗形，漏斗上部开口宽度宽于40mm。所述瓶盖密封盖合在所述宽口瓶身的瓶口处，所述接种管设置在瓶盖上，所述接种管上设有阀门，可外接接种装置。所述宽口瓶身为双层结构，分为外瓶和内胆，所述夹层中间设有保温液体，所述外瓶上设有进液口和出液口，所述进液口和出液口设有电磁阀门。接种瓶内胆中设有温度感应器设置，连接电磁阀门控制器。改进后接种多功能菌种接种装置可直接由育种茄瓶斜面移种至接种钢瓶，菌种液不易洒出，且瓶盖盖合后瓶盖上所设连接管可以连接菌液输出管。