本发明涉及一种考虑不确定性传递的电气耦合系统分布式优化调度方法，属于综合能源系统的运行控制技术领域。本发明方法在电气耦合系统优化过程中充分考虑不确定性在电网和天然气网中的传递，建立电网和天然气网分布式优化模型，从而获得更加合理的电气耦合系统优化运行的参数。本发明方法中建立了考虑风电有功功率不确定性的电网约束条件和天然气网约束条件；建立了电网和天然气网分布式优化模型；提出了电网和天然气网优化信息交互的方法，通过不断交互优化信息，克服了电气耦合系统中由于高比例的可再生能源的注入而存在的诸多不确定性，最终实现电气耦合系统分布式优化，并实现电气耦合系统的安全、可靠和经济运行。