本发明涉及一种运输传染病患者的手术转运车及其使用方法，该手术转运车包括车板、倒扣在车板上端面的透明罩以及安装在车板下方的若干个行走轮，所述透明罩的一侧与车板铰接，车板的上端面设有与透明罩内圈适配的凸台，凸台的侧面固接有一圈气囊，所述气囊位于凸台与透明罩之间，车板下方装有均与气囊连通的吸气泵和出气泵，通过出气泵向气囊内注入气体，通过气囊的膨胀对凸台和透明罩之间进行密封，可以防止透明罩内部的空气流出，从而达到隔离的效果，需要打开透明罩时，通过吸气泵将气囊中的气体抽出，使气囊与透明罩分离，本发明可以对转运车内部的病人进行有效地隔离，且便于医护人员进行操作。