本发明属于纳米淀粉微球改性技术领域，具体涉及一种利用原子层沉积包覆纳米淀粉微球的方法。本发明通过将纳米淀粉微球置于超声垂直流化原子层沉积设备中，开启超声振动，在适当的反应温度和压力下，选择合适活性与蒸汽压的前驱体交替通入，在纳米淀粉微球表面通过活性官能团的交换形成单层化学吸附并完成自限制化学半反应，生成致密的薄膜，对表面的各个部位进行厚度均匀一致的薄膜包覆。本发明采用原子层沉积技术生成的纳米薄膜包覆均匀性较高，尤其对于颗粒较小的纳米淀粉微球可实现其均匀包覆，形成的纳米薄膜结构致密，具有均匀的厚度、优异的一致性，由于其反应机理的特点，可实现对不同粒径纳米淀粉微球的包覆。