本发明公开了一种用于真空预压软地基加固模拟分析仪的密封机构，上盖上设置有用于连通真空预压软地基加固模拟分析仪之内腔的竖直管，该竖直管上设置有第一法兰盘，该竖直管内插有一跟踪杆，该跟踪杆上设置有第二法兰盘，第一法兰盘与第二法兰盘之间设置有具有弹性的密封膜，密封膜内的第一法兰盘与第二法兰盘之间设置有隔离弹性圈，隔离弹性圈用于避免密封膜紧贴在跟踪杆上以及跟踪杆与竖直管之间的缝隙中；随真空预压软地基加固模拟分析仪的抽真空，跟踪杆沿竖直管移动。采用竖直管的方式，避免了测孔与跟踪杆行程过短的技术问题，使跟踪杆既能准确移动又能实现真空预压软地基加固模拟分析仪的完全密封，竖直管上设有滑动导向滚珠。