本发明公开了一种基于多旋翼无人机的湖库水样定点分层采集技术，包括水采样机、多旋翼无人机和地面站，其核心控制器驱动绕管盘电机连同绕管盘一起反转，进水管穿过拘管器以及进水管距离传感器连续下降，可以方便控制进水管下降至不同深度以采集不同深度的水体，磁块靠近进水管距离传感器，核心控制器检测到信号，绕管盘电机连同绕管盘停止转动，核心控制器给上水泵通电，进水管内部成负压，在大气压作用下，水体进入水样瓶中，控制管路切换器使进水管与排水口接通，水采样机即可完成当前深度的水体采样作业，使得多旋翼无人机飞一个来回，同一地点一次性完成不同水深，多个水样采集，大大提高了水体采样的便利性品。