本发明提供了一种基于物联网的医疗废物分类处理方法、系统及存储介质，适用于医疗管理技术领域。该方法包括：获取医疗废物的序列信息；根据所述序列信息获取处理所述医疗废物对应的使用者信息；根据所述使用者信息确定所述医疗废物的风险等级；根据所述序列信息和所述风险等级确定所述医疗废物的存储区，并将所述医疗废物存储至所述存储区，以等待工作人员进行无害化处理。本申请可以根据医疗废物的使用者信息，可以较好地确定医疗废物对应的风险等级，从而进行各个风险等级的医疗废物的分类存储和处理，从而降低医疗垃圾分类不当所造成的职业暴露与感染风险。