本发明提供了一种微生物修复储层胍胶压裂伤害的实验装置及其方法，包括注入与抽真空系统、反应体系储存系统、微生物修复储层压裂液伤害反应系统和数据及样品采集系统，通过不同注入方式及反应条件模拟不同储层胍胶压裂液伤害类型，通过分布在模型不同位置的压力传感器，实现模拟压裂储层不同位置的压力检测，从而构建压裂液伤害过程以及微生物修复压裂液伤害过程中模拟储层的压力场分布，通过不同位置的取样器分离和检测产出流体，实现对储层压裂液伤害污染程度与范围的预测以及微生物修复压裂液伤害效果预测。通过实验测量和定量分析相结合的方法，从而为储层胍胶压裂液伤害的微生物修复技术的大规模工业化应用提供理论指导。