本发明涉及一种椭圆芯保偏光纤的制造方法，包括以下步骤：步骤一、选择合适芯棒的基管，进行预处理；步骤二、制造芯棒，芯棒包括内包层与芯层；步骤三、在芯棒的芯层沉积结束后，先进行芯层内壁一侧的定向刻蚀，刻出月牙型；然后对相对侧刻出相同弧度的月牙型，最终基管内空心圆由最初的圆形刻蚀为椭圆形；步骤四、芯棒沉积、刻蚀结束后，对基管进行正向和反向塌缩，制成一根实心椭圆芯光棒；步骤五、将芯棒放置在沉积后的石英套管中，组合构成椭圆芯保偏光棒；步骤六、光棒进行拉丝，拉制成细径裸光纤，并在裸光纤外表面涂覆光纤涂料，得到最终椭圆芯保偏光纤。本发明通过定向刻蚀，一次成型，减少工艺的程序，稳定性、可靠性提高。