电梯群自动消毒防疫控制方法，解决了现有在电梯群控派梯时不能有效的为乘客提供消毒后的电梯的问题，属于电梯智能控制领域。每部电梯轿厢内设置有防疫装置，用于对电梯轿厢内消毒，本发明包括：S1、当接收到呼梯信号，对被乘用过的空闲电梯进行设定消毒时间的消毒，根据客流判断防疫模式，若为空闲群控防疫模式，转入S2，若为高峰群控防疫模式，转入S3；S2、根据接收到的呼梯信号，派出到达呼梯楼层时能够完成消毒的电梯或当前已经完成消毒的电梯，若接收到呼梯信号且没有到达呼梯楼层时能够完成消毒及已经完成消毒的电梯，则转入S3；S3、根据接收到的呼梯信号派出目前正在消毒的电梯中消毒时间最长的电梯，转入S1。