本发明提供一种极易自燃煤层开采期间采空区煤炭自燃防治系统及使用方法。在工作面原有巷道连接的基础上进行联络巷掘进，使区段进风巷及区段回风巷与盘区进风巷及盘区回风巷均构成连接。在工作面安设局部通风机、风筒、风门、风速及气体浓度传感器，在采空区内埋设束管及温度传感器。将风门、局部通风机、各传感器与地面中央智能控制系统进行连接。确定改变工作面风流方向的条件值，当条件值满足时，地面中央智能控制系统的中央处理器会发出指令改变局部通风机及风门的开闭状态，改变工作面风流方向，防止采空区煤炭自燃。如此反复进行，直到工作面开采结束。本方法具有应用简单，投入成本低、操作方便，系统稳定，效果可靠，实用性强等优点。