本发明公开了一种离子型稀土浅层地下水污染防控方法，针对我国离子型稀土矿基岩浅埋且破碎的共性地质特征，采取如下措施：在开采区深部基岩断裂带构筑水平防渗帷幕，在开采区边缘的浅层基岩破碎带构筑垂向防渗帷幕，阻止浸出液迁移扩散；在防渗帷幕内的富水区安装自控抽提井，控制开采区浅层地下水水位，避免越流污染；在防渗帷幕外围设置水质监测井，监测地下水浸出剂浓度，指导开采区浅层地下水水位控制；开采结束期用清水、低浓度氢氧化钙溶液清洗。通过上述措施，有效控制原位溶浸开采对矿区地表/地下水环境构成影响，并减小开采过程的稀土资源损失。本发明适合于基岩浅埋且破碎的离子型稀土矿山，可助力生态矿山、数字矿山和智能矿山建设。