本发明涉及一种分离器，尤其涉及一种便携式种子分离器。本发明的目的是提供一种能够自动对种子进行分离和收集，提高种子分离效率，减少人工操作的便携式种子分离器。本发明的技术方案是：一种便携式种子分离器，包括有：底座，其顶部一侧设置有电机，靠近电机一侧的底座侧部安装有上下往复机构；传动轴，上下往复机构内的部件上转动式连接有传动轴，靠近电机一侧的传动轴侧部和电机的输出轴之间连接有皮带组件。本发明通过上下往复机构，可自动将放置篓放入水中并抬出水面，无需人工反复抬起放置篓，通过摆动机构，可使放置篓上下移动过程中也能够左右摆动，对放置篓中的种子进行筛选，便于坏种子浮出水面。