本发明公开了一种具有多个独立反应单元的渣油加氢固定床反应器，含有该反应器的渣油加氢系统及其渣油加氢工艺，该反应器包括沿所述反应器纵向方向并联的N个独立反应单元，其中N大于或等于2，所述独立反应单元具有独立的反应物料进料系统和独立的反应产物出料系统，各反应单元的反应产物通过反应器中与上述各反应单元相连通的的反应产物收集系统收集和汇聚，并由反应器下部出料口排出反应器，本发明反应器及其系统和相关工艺整体提高了催化剂的活性资源利用率，在不增加催化剂装填量的情况下，新鲜油气原料与催化剂接触面积增加数倍，可显著延长催化剂床层使用周期，缓解催化剂床层压降，使原料油在最佳反应温度下可长期稳定运转。