本发明涉及样品处理技术领域，提供了一种自动固相萃取装置，包括基座、固相萃取柱、第一软管、第二软管、气缸、自动收集机构和控制箱，固相萃取柱内设置有活塞，活塞、填料与固相萃取柱的内壁之间形成用于容纳液体的容纳腔，活塞的内部开有将容纳腔与外界连通的连通孔，连通孔内设置有密封塞，密封塞能够控制连通孔的开闭和活塞的移动，第一软管的一端与样液筒连通、另一端与容纳腔连通，第二软管的一端与试剂筒连通、另一端与容纳腔连通气缸的一端与基座连接、另一端与密封塞连接，自动收集机构用于自动收集从固相萃取柱底部的出液口排出的液体。本发明提供的一种自动固相萃取装置，能够自动调节回收率和回收时间。