本发明公开了一种生物质粉碎发酵系统，包括收集模块、辅助模块、驱动模块、粉碎模块和底板，所述底板的上方设置有收集模块。本发明通过设置收集模块，可以方便使用时更好的收集生物质，同时还可以防止生物质在加工过程中飞出到空中，通过设置辅助模块，而可以将加工好的生物质用气动的方式推动到锥形罩顶端的开口处，通过设置驱动模块和粉碎模块，可当加工好的生物质到达锥形罩顶端开口处，可以更好的帮助使用者收集，从而提高了本装置的生产效率。