本发明公开了一种基于共轭频率调制的高动态下码捕获方法，发送端设计组合信号，由两部分组成，前面由频率调制信号及其共轭信号交替拼接构成，后面为扩频调制信号；接收端接收组合信号经下变频处理后同时送入非共轭通道及共轭通道进行匹配滤波，并对匹配滤波结果求模，获得两通道判决数据；将两通道判决数据送入判决器，根据两通道联合判决结果确定捕获时刻，并开始产生本地扩频码。本发明利用频率调制信号及其共轭信号自相关曲线在相同多普勒频偏情况下相反方向的偏移，和频率调制信号与扩频调制信号的组合技术，消除了频偏对码捕获的影响，实现在高动态下、大多普勒频偏下高精度的码捕获。