一种全密闭式养殖系统，包含屋舍单元、至少一承载装置、第一排风装置、氧气供应装置，及第二排风装置。屋舍单元的家禽家畜饲养室、空气处理室、第一空气交换室及第二空气交换室共同形成一封闭式循环空间。承载装置适用于供家畜活动。第一排风装置与第二排风装置用以使封闭式循环空间中的气体循环流动。氧气供应装置包括第一氧气供应模块及第二氧气供应模块。第一氧气供应模块与第二氧气供应模块借由藻类进行光合作用使家畜产生的二氧化碳转换成氧气传送回家禽家畜饲养室，使家畜或家禽在模块化密闭式养殖系统中不须与外界交换空气也能独立生存，达到防疫的功效。