本发明公开了一种基于振动监测的弱刚性结构钻孔方法，包括以下步骤：S1：依据零件结构模态振型仿真计算结果进行加工区域划分；S2：针对各区域分别选定一个孔作为参数标定孔，编制加工程序；S3：加工参数标定孔并采集振动信号，依据颤振识别结果进行转速调整，满足许用要求后完成区域加工；S4：完成一个区域的孔加工后，采用相同的流程进行下一个区域孔加工，直到完成零件结构加工。本发明针对飞机结构件弱刚性结构特征，实现动态切削参数的动态变换，避免孔位偏差、孔径超差等加工质量问题，降低零件报废率，提高零件钻孔成功率，避免进行传统费时费力，且效果极为有限的试切试验，避免加工故障的产生，适宜广泛应用。