本发明公开了一种基于动力模态的超重力离心机安全运行控制与提高方法。对离心机转动动力模态测试，得到不同离心加速度和不同配重下振动模态和固有频率；处理得到一阶固有频率曲线和旋转频率曲线，找到两条曲线间的危险点，设置安全因子并判断安全因子是否满足，再进行加固处理；另外处理旋转二倍频率曲线，根据旋转二倍频率曲线和旋转频率曲线的交点获得安全运行回避区间的上下限，控制离心机的旋转频率和速度，使得离心机的离心加速度在当前配重对应下回避区间之外进行工作运行。本发明方法获得超重力离心机在转动下动力性能的变化，控制并提高超重力离心机运行安全性，可操作性强，在保证离心机安全运行的同时节约分析成本，易于推广使用。