本发明具体涉及一种基于逆流色谱分离皂角刺中黄酮单体的方法，现有研究证明皂角刺中的黄酮类成分具有良好抗肿瘤及抗氧化活性。本发明目的在于针对皂角刺中高价值黄酮单体进行提取分离，基于该目的，本发明提供了一种基于逆流色谱分离皂角刺中黄酮单体的方法，首先制备皂角刺的乙醇提取物，依次采用石油醚、乙酸乙酯萃取所述乙醇提取物，再通过逆流色谱分离所述乙酸乙酯萃取物，最后通过色谱分离得到了五种黄酮单体。本发明方法克服了传统制备方法操作复杂，样品死吸附损失，收率低等缺点。本方法效率高，操作简单，综合成本低，具有很好的推广使用价值。