本发明公开了一种有机羊肚菌外源营养袋及其应用。所述有机羊肚菌外源营养袋以干重记包括质量分数在30％‑50％的中药渣，余量为营养袋基质；所述中药渣含有黄芪药渣、苦参药渣、以及蒲公英药渣。其应用于有机羊肚菌的种植：在羊肚菌播种后，菌丝已经长满畦面时，将所述有机羊肚菌营养袋侧面开口，朝下贴扣菌床。本发明由于营养袋中添加了复合中药残渣替代传统基质，含有多种抗菌活性成分。经栽培出菇，该营养袋生产的羊肚菌子实体粗大，形状完整，未出现畸形菇、烂菇等，有效防止了细菌、真菌病害感染和多种虫害的侵蚀，杜绝使用化学药剂对羊肚菌和土壤中农药残留的影响，大力节省了栽培羊肚菌过程中人工预防病虫害的时间和经济成本。